Les fonds du musée comprennent plus de 30 000 objets répartis dans 4 départements (sciences archéologiques, artistiques, culturelles, historiques et naturelles), ainsi qu'une vingtaine de collections de musée et de collections de documentation. L'exposition permanente est actuellement composée de quatre unités d'exposition présentées dans deux bâtiments historiques situés dans le centre de l'île, à proximité du port et de l'hôtel: l'église Saint-Germain et le bâtiment des bains de vapeur. Dans l'église de st. Des expositions occasionnelles mineures sont organisées pendant les mois d'été.