Crkvena zbirka koja sadrži: slike starih majstora, skulpture, liturgijske predmete i opremu, crkveno ruho, numizmatičku zbirku, raritetne knjige i rukopise, te vrijednu biblioteku. U Franjevačkom samostanu nalazi se najpoznatija slika fonda starih majstora na otoku: “Posljednja večera” od Matea Ponzonia Pončuna iz ranog 17.st. U samostanskom vrtu je jedinstveni stoljetni čempres.