Lokrum est une île verte, recouverte de terres fertiles et d'une flore luxuriante. Cependant, ce qui se cache sous cette couche mince n’est clairement visible que sur le rivage: toute l’île est constituée d’épaisses couches de roches sédimentaires - calcaire et dolomite.Les roches sédimentaires cachent une histoire géologique intéressante, vieille de millions partie de la plate-forme carbonatée Adriatic-Dinaridique. Les vestiges de la plate-forme constituent toujours la région karstique en Croatie, de Karlovac, Gorski Kotar et Lika à l'Istrie, au littoral croate et à la Dalmatie, mais sa plus grande partie a sombré sous la mer Adriatique.