Lokrum egy zöld sziget, termékeny földdel és buja növényzettel borítva. Az a vékony réteg alatt fekvő rész azonban csak a parton látható: az egész sziget vastag üledékes kőzetekből áll - mészkőből és dolomitból. Az üledékes kőzetek érdekes geológiai történetet rejtenek millió évvel ezelőtt - régen az Adriai-Dinarid-karbonát-platform része. A platform maradványai továbbra is a karsztvidéket alkotják Horvátországban, Karlovac-tól, Gorski Kotar-tól Likától Isztriáig, a horvát part menti és dalmáciaig, de legnagyobb része az Adriai-tenger alá süllyedt.