Crkva je podignuta prije 1500. godine kada je ponovo ojačao život pustinjaka na Marjanu. Vizitator Prioli 1603. g. navodi je kao crkvu sv. Marije ad Presepe, tj. „ od jaslica „.Bila je to jednostavna, jednobrodna građevina presvođena bačvastim svodom s profilom slomljenog gotičkog luka. Nedavnim radikalnim prepravkom crkve taj dio je izmijenjen.Posle Prvog svetskog rata crkva je zapuštena te je služila kao staja. Godine 1927. crkvu je obnovilo društvo Marjan.Na istoku crkvice Gospe od Betlema mala je pravokutna apsida, na pročelju je zvonik na preslicu, a s desne strane ulaza uzidana je kamenica za posvećenu vodu. U unutrašnjosti je kameni oltar u sredini kojeg je prizor Kristovo rođenje, sa strane su likovi sv. Jere i sv. Ante Pustinjaka. U timpanu poviše prikazano je Raspeće Kristovo. Oltar je rad nekog domaćeg majstora iz 1500. g. kada se križaju utjecaji renesanse i gotike.