Kronike govore da se već 1342. godine započinje graditi prva crkva sv. Vlaha kao stolna crkva na mjestu sadašnje.Kako je Ston postao biskupsko središte ova crkva postaje katedrala. Stradala je u velikom potresu 1667. godine.Odlukom dubrovačkog Senata nakon potresa pristupilo se odmah gradnji nove katedrale na mjestu porušene.Ponovni potres iz god.1850. porušio je i ovo zdanje te se 1870. godine sagradila na približno istom mjestu današnja crkva sv. Vlahakoja je izvedena u pseudo - bizantskom stilu.1996. godine stradala je u razornom potresu te se niz godina obnavljala ,a za misno slavlje otvorena je od 3.2.2017.godine