Kronike pravijo, da je že leta 1342 na mestu sedanjosti bila postavljena prva cerkev svetega Vlaha. Kot Ston je postal škofovo središče, je ta cerkev postala katedrala. Uničen je bil v velikem potresu leta 1667. Odločitev dubrovniškega senata po potresu je bila, da nemudoma začne gradnjo nove katedrale na mestu, ki je bilo porušeno. Leta 1850 je bil spet potres, ki je to zgradbo tudi porušil Današnja cerkev svetega Vlaha je bila zgrajena v psevdo bizantinskem slogu. Leta 1996 jo je opustošil potres in več let prezidaval.