Muzej sačinjava više zbirki na nekoliko lokacija, a čini ih bogata etnografska i povijesno umjetnička građa. Tri zbirke se mogu posjetiti u Jelsi, jedna u Vrboskoj – Ribarska zbirka i jedna na Humcu – Vinogradarska zbirka. Jedinstven po svom sadržaju je muzejski prostor, u obiteljskoj kući umjetnika Jurja Dobrovića, koja se nalazi na trgu sv. Ivana. Unutar kuće izgrađene krajem 19 st. u izvorno sačuvanom ambijentu izloženi su predmeti i umjetnine, te dokumenti, koji svjedoče o građanskoj obitelji i društvenom životu s početka 20. st. u Jelsi. Dodatnu vrijednost uz kulturno povijesnu zbirku u kući Dobrović donosi zbirka grafika, slika i reljefa umjetnika – donatora Jurja Dobrovića, a kako nam to zorno prenosi Višnja Zgaga ravnateljica Muzejskog dokumentaciskog centra : kronologija i homogenost pojedinih ciklusa osnovna su načela postava, diskretno sugerirajući pitagorejsko nasljeđe što prožima rad tog umjetnika.

Muzej je otvoren : Pon – Ned 10:00-12:30; 18:30-21:00