Osnovna misija današnjega Narodnog muzeja Zadar obuhvata sistematsko sakupljanje, čuvanje, izlaganje, dokumentovanje, te stručnu i naučnu obradu pokretnih i nepokretnih predmeta civilizacijske, kulturne i prirodne baštine, nastale u periodu od XIII. veka do naših dana, a područje interesa i istraživanja je Zadarska županija, ili šire, severna Dalmacija sa ostrvima i neposrednim kopnenim zaleđem (Bukovica, Podvelebitski kraj, Ravni kotari). Muzej je često puta suorganizator ili domaćin različitih izložbi drugih ustanova, izdaje monografska dela, kataloge, plakate, razglednice itd. Uz to je i organizator ili domaćin stručnih i naučnih skupova, kulturnih manifestacija, koncerata, promocija knjiga, radionica itd.