Kościół św. Franciszka to jednonawowa budowla z gotycką sklepioną półkolistą absydą. Wschodnia apsyda jest architektonicznie połączona z dwoma wydłużonymi gotyckimi oknami. Te same okna były z pewnością od strony południowej, ale z powodu późniejszej budowy dzwonnic. Dzwonnica kościoła została ukończona w 1743 roku. Naprzeciw kościoła franciszkańskiego był klasztor Claris. Clareys mają bardzo ścisłą klauzulę, więc narzekali przy budowie dzwonnicy franciszkańskiej, ponieważ z ich ogrodu można było zobaczyć. Kościół na południowej fasadzie ma trzy gotyckie okna. Wyżej wspomniane okna są nieobecne od strony północnej, ponieważ prawdopodobnie znajdowały się tam wcześniejsze wały kościoła, klasztoru i miasta. Z dekoracyjnego plastiku należy wspomnieć weneckiego skrzydlaty lew z zamkniętą księgą z XIII. wieku, dziś znajduje się na fasadzie nad murem wejściem. Zamknięta książka wskazuje na fakt, że Wenecja była wtedy w stanie wojny. Kościół został zresztą przebudowany i przedłużony, więc te drzwi mogły kiedyś być głównym wejściem do kościoła, a potem ta ulga mówi wiele o czasie jego budowy.

Klasztor został zbudowany na północ od dzisiejszego kościoła. Nie ma zbyt wielu informacji na temat budowy klasztoru, ale wiadomo, że w 1500 roku dalmatyński proboszcz Sebastian Justiniani zezwolił na otwarcie otworów okiennych po części wzdłuż murów miasta. W 1625 r. Powstała cysterna z krużgankami zasilanymi wodą deszczową, płynącymi z czterech dachów. Potwierdza to, że do tego czasu kościół został już rozbudowany i że istniały wszystkie budynki klasztorne (z wyjątkiem części wschodniej - seminarium z 1910 r.).

Kościół i klasztor św. Franciszkanie dużo mówią o tradycji zakonu franciszkańskiego w Krk. Istnieje legenda, napisana w 1500 r., Że św. Z powodu swojej burzy Franciszek wylądował w Krk i spotkał tu pustelnika, który przyjął jego nauki, po czym założono Zakon Franciszkanów na Krku.