Quella di S. Maria è una chiesa alto-gotica a una navata, già menzionata nello Statuto di Lèsina del 1331. Ampliata nel XV secolo, viene dotata di tre navate e, molto probabilmente, di una torre difensiva. Si ritiene che sia stata completamente fortificata nel 1535. Grazie alla chiesa fortificata di S. Maria, la gente di Jelsa poté resistere all’assalto del signore algerino Uluč – Alija, avvenuto nel 1571. È stata ristrutturata nel 1999. Il quadro sull´altare mostra la Vergine sotto le nuvole, sul lato destro c´è S. Antonio di Padova con un bambino nudo nelle braccia, San Rocco in ginocchia, con un cane accanto. Il quadro viene attribuito a Palma il Giovane (1544 - 1628).