La parroquia de San Juan Bautista, fue fundada por el decreto de la ordenanza de Zadar de ese tiempo. La parroquia tiene sus raíces en la iglesia medieval del mismo nombre, que se encontraba fuera de las murallas de la ciudad, erigida en la segunda mitad del siglo XIV. Ya se mencionó en el año 1312, y al lado de esa iglesia vivían los frailes de los eremitas de la tercera orden de St. Frane, que cuidaban a los pacientes infectados en un hospicio cercano. A principios del siglo XV, se erigió un monasterio cerca de la iglesia. Debido a la invasión turca, las autoridades de la ciudad ordenaron la demolición de todos los edificios existentes, por lo que el monasterio de Sv. John en 1536, y la iglesia sufrió graves daños. En los siglos posteriores, la iglesia fue reparada repetidamente y en la segunda mitad del siglo XIX se extendió.