A Rijeka város múzeumát már 1875-ben megemlítik a városi történelemben, amikor Ferenc József kormányzó egy pohárot adományozott Rijeka lakosainak annak érdekében, hogy megőrizze azt saját városi múzeumának kiállításaként. végül 1893-ban nyitották meg a Museo Civico Városi Múzeumot, 1933-ban pedig a Sušak Városi Múzeumot.

A modern intézményként a Rijeka Város Múzeuma a Rijeka Népi Forradalmi Múzeumból származik, amelyet a Susak Önkormányzat Városi Népi Bizottsága hozott létre 1961. május 30-án. A Múzeum székhelye Az emberek forradalma Laval Nugent volt házában, a Trsat kastély mellett, a Petr Zrinski utcában volt. A nem megfelelő körülmények miatt 1976. november 12-én áthelyezték egy új, modern, célra épített épületbe, állandó kiállítással, szervezett gyűjteményekkel és megfelelő múzeumi szabványokkal.

Intézményként működött 1994. április 11-ig, amikor a Városi Tanács határozatával a Nemzeti Forradalom Múzeumát Rijeka város Múzeumá változtatta át. Az új létesítmény továbbra is ugyanabban az épületben működött, amely a belvárosban található, a Governor's Palace Parkban. Az épület modernista tárgy, amelyet Neven Šegvić építész 1976-ban tervezett a múzeum számára. A projektért Neven Segvic építész republikánus és szövetségi díjat kapott a horvátországi legjobb építészeti eredményekért 1976-ban. Az épület mellett a Városi Múzeum örökölte elődjének dokumentumait, és újonnan alakult gyűjteményekben tárolja.